Grupi terrorist Rrjeti Haqqani filloi të shfaqej në raportet e agjencive të inteligjencës që veprojnë në Afganistan dhe Pakistan nga 2004-2005. Emri i rrjetit shoqërohet me emrin e komandantit të terrenit Jalaluddin Haqqani, i cili luftoi kundër trupave sovjetike.
Gjatë qëndrimit të trupave sovjetike në Afganistan, Jalaluddin Haqqani ishte një komandant i famshëm në terren, ai u mbështet nga Agjencia Qendrore e Inteligjencës e SHBA, duke siguruar ndihmë financiare.
Pas tërheqjes së trupave sovjetike, lufta civile në Afganistan vazhdoi. Haqqani ka qenë i përfshirë në disa operacione të mëdha, autoriteti i tij është rritur ndjeshëm. Në vitin 1992, ai mori pjesë në negociatat e paqes midis palëve ndërluftuese, pastaj u bë Ministri i Drejtësisë i Afganistanit dhe mbajti këtë post për katër vjet.
Pas kapjes së Kabulit nga Talibanët në 1996, Haqqani u zhvendos në anën e tyre dhe u emërua Ministër i Punëve të Kufirit. Në praktikë, kjo çoi në faktin se ai kontrollonte plotësisht provincën e Paktia, e cila strehonte kampet e stërvitjes së al-Kaidës që u shkatërruan më vonë nga amerikanët. Pas fillimit të operacionit të SHBA kundër Talibanëve, Haqqani filloi të komandonte forcat e tyre të armatosura, por nuk mundi t'i rezistonte pushtuesve. Talibanët u mundën, Haqqani filloi të zhvillonte një luftë guerile dhe shumë shpejt u emërua nga amerikanët si një nga gjashtë terroristët më të kërkuar të Talibanëve.
Veprimet e Haqqani kundër forcave qeveritare dhe ushtrisë amerikane ishin shumë të suksesshme, që nga mesi i viteve 2000, raportet nga Afganistani filluan të përmendnin "Rrjetin Haqqani", i cili tregonte rritjen e ndikimit të këtij komandanti lufte. Që nga viti 2006, së bashku me Haqqani, djali i tij Sirajuddin (Siraj) ka qenë në krye të rrjetit. Që nga viti 2007, ishte Siraj ai që drejtoi grupin në lidhje me përkeqësimin e shëndetit të babait të tij. E lidhur ngushtë me Talibanët, grupi terrorist Haqqani veproi në mënyrë të pavarur dhe kurrë nuk iu nënshtrua askujt.
Së shpejti, udhëheqja e "Rrjetit Haqqani" tashmë përfshinte disa anëtarë të familjes së themeluesit të saj dhe një numër komandantësh në terren, grupi kontrollonte disa provinca të Afganistanit. Që nga viti 2008, grupi filloi të përdorë bombardues vetëvrasës për të kryer sulme terroriste, autoritetet amerikane filluan ta konsiderojnë atë si kërcënimin më të madh për trupat amerikane në Afganistan. Sipas shërbimeve të inteligjencës, numri i anëtarëve të rrjetit në vitin 2010 varionte nga 4 në 15 mijë njerëz. Ishte e vështirë të vlerësohej më saktë numri i militantëve për shkak të natyrës së mbyllur të grupit.
Që nga viti 2008, djali i themeluesit të grupit, Siraj Haqqani, është përfshirë nga Shtetet e Bashkuara në listën e terroristëve; që nga viti 2009, një shpërblim prej 5 milion dollarësh është njoftuar për informacion në lidhje me të. Në vitet në vijim, Nasiruddin Haqqani, Khalil al-Rahman Haqqani dhe Badruddin Haqqani u shtuan në listën terroriste.
Për një kohë të gjatë, autoritetet amerikane nuk guxuan të përfshinin zyrtarisht "Rrjetin Haqqani" në numrin e grupeve terroriste, pasi ata ende shpresonin të arrinin një marrëveshje me udhëheqësit e një lëvizjeje të tillë me ndikim. Shërbimet e inteligjencës së vendit madje mbajtën takime me përfaqësuesit e rrjetit, por ata nuk arritën të arrijnë ndonjë marrëveshje.
Situata u pastrua përfundimisht në Shtator 2011, kur terroristët nga Rrjeti Haqqani sulmuan selinë e forcave të NATO-s dhe ambasadën e SHBA në Kabul. 16 persona u bënë viktima të sulmit. U bë e qartë se nuk do të ishte e mundur të arrihej një marrëveshje me terroristët dhe në shtator 2012 u njoftua se Shtetet e Bashkuara kishin shtuar Rrjetin Haqqani në listën e grupeve terroriste.
